Excisão de Sequencias flanqueadoras pelo R
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Excisão de Sequencias flanqueadoras pelo R
Fala galera, sou noob no R e queria uma dica de como fazer a seguinte função, ou se a mesma já existe:
Eu trabalho com análise de seqüências de DNA, porém, estas possuem outras pequenas seqüências que as flanqueiam, Ex:
TTAGGGTTAGGGGCATTCGTCAGCTACTAGATGCAGGGTCGGGTTAGGGTT
Há alguma forma de eu entrar com minhas seqüências ( todas em uma tabela por ex. ) e retirar essas seqüências flanqueadoras (vermelho) já que estas são comuns a todos os meus dados, e gerar uma nova tabela só com as seqüências de interesse, ao invés de fazer isso seqüência por seqüência ?
Desde já, agradeço!
Eu trabalho com análise de seqüências de DNA, porém, estas possuem outras pequenas seqüências que as flanqueiam, Ex:
TTAGGGTTAGGGGCATTCGTCAGCTACTAGATGCAGGGTCGGGTTAGGGTT
Há alguma forma de eu entrar com minhas seqüências ( todas em uma tabela por ex. ) e retirar essas seqüências flanqueadoras (vermelho) já que estas são comuns a todos os meus dados, e gerar uma nova tabela só com as seqüências de interesse, ao invés de fazer isso seqüência por seqüência ?
Desde já, agradeço!
AlainVBarros- Mensagens : 2
Data de inscrição : 29/07/2014
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